2026-1337 - Ingénieur de recherche au sein d'une plateforme de bioinformatique F/H

Fri, 17 Apr 2026 22:07:34 Z

Domaine / métier : 02 - Catégorie A - Ingénieur de recherche (IGR)/A - Sciences du vivant de la terre et de l'environnement - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Nature de l'emploi : Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
Description du poste :
Fonctions : Ingénieur-e de recherche au sein d’une plateforme de bioinformatique Emploi-type : A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données Catégorie : A Corps : IGR BAP : A Poste ouvert aux titulaires et aux contractuels (CDD de 3 ans). A pourvoir à compter du 1er septembre 2026. Au sein de la plateforme d’Analyse Bioinformatique, la mission de l'ingénieur-e est d’analyser les données « omique » en collaboration avec les biologistes, de former les utilisateurs aux méthodes d'analyse, de développer les outils informatiques et de mettre en place et maintenir des services WEB proposés aux équipes de recherche (serveurs Galaxy, serveur d'environnement de programmation R ou python, serveurs de stockage, etc). Activités principales : Concevoir, développer et diffuser les outils d’analyse bioinformatique de la plateforme Assurer le bon fonctionnement de son infrastructure informatique Conduire des projets de développement technologique Participer à la veille scientifique et technologique de la plateforme Concevoir et proposer des solutions d’analyse adaptées aux biologistes Concevoir et diffuser et animer les actions de formation de la plateforme Participer aux actions organisées par les réseaux auxquels la plateforme est affiliée (IFB, IBISA, France-Génomique, Réseau Omique de SU) Participer à la rédaction de dossiers dans le cadre des demandes de financement

Connaissances transversales requises : Organisation et fonctionnement de la recherche et de l’enseignement supérieur en France Organisation et fonctionnement de Sorbonne Université Réglementation applicable à son domaine d’activité professionnelle Statuts, règlements et procédures de gestion des personnels des établissements publics d’enseignement supérieur et de recherche Savoir-faire requis : Maîtrise de la programmation Python et/ou R Maîtriser les techniques d’analyse de données (réduction de la dimension, clustering, régression, tests.) Expertise d’analyse dans au moins un des domaines suivants: single-cell RNAseq, transcriptomique spatiale, épigénomique Capacité à interagir avec les biologistes (bases solides en génomique) Capacité à prioriser les développements planifiés et les demandes des utilisateurs Capacité à proposer des solutions d’analyse en face d’un problème de biologie Savoir communiquer ses résultats à des non spécialistes Maîtriser l’anglais scientifique (niveau B2 requis) Savoir-faire transversaux : Capacité à hiérarchiser et à prioriser les tâches et organiser son activité en tenant compte des contraintes et des échéances Capacité à conduire et accompagner un projet Capacité à élaborer des outils d’analyse et de synthèse et en rendre compte Capacité à définir des indicateurs de suivi et à analyser les résultats Savoir-être : Bon relationnel et sens du travail en équipe Organisation et rigueur Sens du service public
Niveau d'études : Niveau 7 - Bac + 5

2026-1297 - Responsable du pôle de bio-informatique F/H

Mon, 30 Mar 2026 13:46:34 Z

Domaine / métier : 02 - Catégorie A - Ingénieur de recherche (IGR)/A - Sciences du vivant de la terre et de l'environnement - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Nature de l'emploi : Emploi ouvert uniquement aux contractuels
Description du poste :
Fonctions : Responsable du pôle de bio-informatique Catégorie : A Corps : IGR BAP : A CDD de 1 an, renouvelable. A pourvoir à compter de mars 2026. Mission : Le/La responsable du pôle de bio-informatique de l’unité assure le développement et l’automatisation des workflows d’analyse de données omiques, la structuration des bases de données et des systèmes d’information, ainsi que l’implémentation et le développement des programmes informatiques associés aux plateformes automatisées de l’unité. Activités principales : Concevoir des workflows automatisés pour l’analyse de données ou le pilotage d’instruments Concevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données Guider le déploiement de l’infrastructure informatique des plateformes de la BFASU Définir le plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé Analyser des données de génomique (séquençage), protéomique et métabolomique (MS) Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques Gérer l'ensemble des moyens techniques alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de données Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiques Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats Conduite de projets : Oui Encadrement : Non

Connaissances transversales requises : Connaissance théorique des différents types de protocoles expérimentaux biologiques Connaissance approfondie des méthodes de recueil, d'analyse et de traitement des données Connaissance solide en informatique : maîtrise des systèmes UNIX/LINUX, clusters de calculs, maîtrise d’un ou plusieurs langages de programmation, dont obligatoirement Python (Bash, C++, R, JavaScript, HTML, PHP, Java, PERL), maîtrise de la gestion des bases de données SQL et interfaces web (Apache, Django). Maîtrise de logiciels de gestion de version (Git, GitLab Maîtrise des problématiques liées aux Big Data Connaissance générale des approche d’IA/ML appliquées à l’ingénierie du vivant Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues) Savoir-faire : Maîtrise des techniques principales d’analyse statistique de données scientifiques (paramétrique/non-paramétrique/bayésien) Savoir développer des outils de traitements automatisés de données biologiques pour les appliquer à des technologies de recherche en biologie Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques Développer une expertise scientifique et technologique Encadrer des étudiant-es Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires) Savoir-être : Aptitude à s’inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipe Capacité d’innovation et de créativité, d’initiative et autonomie dans le travail Rigueur, organisation, méthode Diplôme réglementaire souhaité : Doctorat Domaine de formation souhaité : bioinformatique
Niveau d'études : Niveau 7 - Bac + 5
Langue / Niveau :
Anglais : 4 - Niveau avancé (B2)

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2026-1337 - Ingénieur de recherche au sein d'une plateforme de bioinformatique F/H

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